1968 yılında Erzurum’da doğan Prof. Dr. Gündoğdu, ilk ve orta öğrenimini Erzurum’da tamamladı. ODTÜ Makine Mühendisliği Bölümünden mezun olduktan sonra Atatürk Üniversitesi Makine Mühendisliği Bölümünde araştırma görevlisi olarak göreve başladı. YÖK burslusu olarak Amerika Birleşik Devletleri’ne lisansüstü eğitimi için gitti. University of Miami’de yüksek lisansını ve Rensselaer Polytechnic Institute’te (RPI) doktorasını yaptı. Genel olarak biyomekanik, modelleme ve yapay zekâ konularında kendini geliştirdi.

Yurda dönüşünden sonra yine Atatürk Üniversitesinde mecburi hizmetini tamamladı. Fen Bilimleri Enstitüsünde bir süre müdür yardımcılığı görevini yürüttü. Türkiye’deki bu on yıllık çalışma hayatının sonunda Suudi Arabistan’da Cidde’deki Melik Abdülaziz Üniversitesinde üç yıl boyunca Endüstri ve Makine Mühendislikleri bölümünde doçent olarak dersler verdi. Yurda tekrar dönüşünde Atatürk Üniversitesinde profesörlüğünü 2014 yılında aldı. Bir süre Makine Mühendisliği bölüm başkanlığı ve daha sonra da Iğdır Üniversitesi Mühendislik Fakültesi dekanlığı ile yine aynı üniversitenin Fen Edebiyat Fakültesi vekil dekanlığını yürüttü.

Halen Atatürk Üniversitesinde devam etmekte olan Prof. Dr. Gündoğdu’nun, 50’nin üzerinde bilimsel makalesi, 30’un üzerinde bilimsel toplantı sunusu, telif ve tercüme 7 kitabı ve 4 kitap bölümü yazarlığı mevcuttur. 5 doktora ve 15’in üzerinde yüksek lisans öğrencisi mezun eden Prof. Dr. Gündoğdu 10’un üzerinde tamamlanmış projesi ve bir ulusal patenti ile bir de ABD patent başvurusu mevcuttur.

Prof. Dr. Gündoğdu, ileri seviyede İngilizce ve Arapça bilmektedir, evli ve dört çocuk babasıdır.